Ü Biostatistik / Bioinformatik
Dozent:innen: Univ.-Prof. Dr. Miguel Andrade; Dr. Anne Bicker; Univ.-Prof. Dr. Susanne Foitzik; Univ.-Prof. Dr. Susanne Gerber; apl. Prof. Dr. Maria Griebeler; Univ.-Prof. Dr. Thomas Hankeln; Sören Lukas Hellmann; apl. Prof. Dr. Elmar Jaenicke; Univ.-Prof. Dr. Martin Kaltenpoth; apl. Prof. Dr. Bernhard Lieb; Dr. Florian Menzel; Carina Osterhof; HD Dr. Michael Schaffeld; Dennis SeiwertKurzname: 10.026.042.Ü
Kurs-Nr.: 10.026.042.Ü
Kurstyp: Übung
Voraussetzungen / Organisatorisches
Für die Teilnahme an den Veranstaltungen in Modul 4-2: Biostatistik und Bioinformatik müssen Modul 4-1: Mathematik und Statistik erfolgreich abgeschlossen und die Veranstaltungen in Modul 8: Genetik bereits absolviert sein. Bei Studienbeginn im WiSe wird Modul 4-2: Biostatistik und Bioinformatik in der Regel bereits im 4. Fachsemester belegt. Bei Studienbeginn im SoSe kann dieses Modul jedoch erst im 5. Fachsemester absolviert werden.Die Veranstaltungen in Modul 4-2 Biostatistik und Bioinformatik (Vorlesung und Übung am Computer) werden in zwei halbtägigen Parallelen als 2-wöchige Blockveranstaltung durchgeführt:
Vormittagsparallele, Mo.-Fr., 19.08.-30.08.2019, 8.15-12.00 Uhr, Hörsaal Anthropologie, Bentzel-Weg 7, Raum -1 131
Nachmittagssparallele, Mo.-Fr., 19.08.-30.08.2019, 13.15-17.00 Uhr, Hörsaal Anthropologie, Bentzel-Weg 7, Raum -1 131
Bitte melden Sie sich in Jogustine für die beiden Übungsparallelen im Ranking-Verfahren an. Nach Ablauf der Anmeldefristen werden die Anmeldelisten geschlossen und Sie werden einer der beiden Parallelen zugeteilt.
Anmerkung: Die Übungszeiten beinhalten auch die Zeiten der Vorlesung. Trotzdem ist eine separate Anmeldung für die Vorlesung (Veranstaltung: VL Biostatistik / Bioinformatik, 10.026.042.VL) erforderlich.
Inhalt
- Einführung und Anwendung bioinformatischer Methoden in der Genomforschung: Gen- und Genomstruktur, DNA-Sequenzierungsmethoden, Bewertung und Editieren von DNA-Sequenzen, DNA- und Protein-Sequenzalignment, Sequenzdatenbanken und Suchalgorithmen, Generkennung und –annotation, Genombrowser
- Molekulare Phylogenie: Datenerhebung, Multiples Sequenzalignment, Evolutionsmodelle, Methoden der Stammbaum-Rekonstruktion
- Proteinstruktur und Domänen, Proteinstrukturdatenbanken, Protein-Interaktionen
- Einführung und Anwendung biostatistischer Verfahren in der Ökologie, Verhaltens- und Evolutionsbiologie: Grundlegende Konzepte, Datenverteilungen, Versuchsdesign, parametrische und nicht-parametrische Testverfahren, Allgemeine Lineare Modelle, Einführung in Datenauswertung und Darstellung mittels Statistikprogrammen (z.B. „R“)
Zusätzliche Informationen
Modulprüfung: E-Klausur über die Inhalte der Vorlesung und Übung (1 Stunde, 2 Durchgänge)Klausurtermin: Mo., 16.09.2019, 09.00-12.00 Uhr, Hörsaal Anthropologie, Bentzel-Weg 7, Raum -1 131
Inhalt der Veranstaltungen
Kurzbeschreibung :
Slides about using Chimera for protein structure representation / Andrade
Beschreibung:
Inhalt der Veranstaltungen
Kurzbeschreibung :
Slides about protein domains/ Andrade
Beschreibung:
Inhalt der Veranstaltungen
Kurzbeschreibung :
Slides about protein structure modelling by homology/ Andrade
Beschreibung:
Inhalt der Veranstaltungen
Kurzbeschreibung :
Slides about using Chimera for protein structure representation / Andrade
Beschreibung:
Inhalt der Veranstaltungen
Kurzbeschreibung :
Slides about protein domains/ Andrade
Beschreibung:
Informationen
Kurzbeschreibung :
Slides about protein structure modelling by homology/ Andrade
Beschreibung:
Kurse in Kleingruppen
Biostatistik/Bioinformatik-Nachmittagsparallele
| Datum (Wochentag) | Zeit | Ort |
|---|---|---|
| 19.08.2019 (Montag) | 13:15 - 17:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 20.08.2019 (Dienstag) | 13:15 - 17:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 21.08.2019 (Mittwoch) | 13:15 - 17:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 22.08.2019 (Donnerstag) | 13:15 - 17:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 23.08.2019 (Freitag) | 13:15 - 17:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 26.08.2019 (Montag) | 13:15 - 17:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 27.08.2019 (Dienstag) | 13:15 - 17:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 28.08.2019 (Mittwoch) | 13:15 - 17:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 29.08.2019 (Donnerstag) | 13:15 - 17:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 30.08.2019 (Freitag) | 13:15 - 17:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
Biostatistik/Bioinformatik-Vormittagsparallele
| Datum (Wochentag) | Zeit | Ort |
|---|---|---|
| 19.08.2019 (Montag) | 08:15 - 12:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 20.08.2019 (Dienstag) | 08:15 - 12:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 21.08.2019 (Mittwoch) | 08:15 - 12:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 22.08.2019 (Donnerstag) | 08:15 - 12:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 23.08.2019 (Freitag) | 08:15 - 12:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 26.08.2019 (Montag) | 08:15 - 12:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 27.08.2019 (Dienstag) | 08:15 - 12:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 28.08.2019 (Mittwoch) | 08:15 - 12:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 29.08.2019 (Donnerstag) | 08:15 - 12:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |
| 30.08.2019 (Freitag) | 08:15 - 12:00 | -1 131 ANT 1430 - Anthropologie (Neubau) |