In den Core Facilities am Fachbereich Biologie erhalten Sie kompetente Unterstützung für Ihre fachwissenschaftlichen und technischen Fragestellungen. Es stehen vier Teams mit unterschiedlicher wissenschaftlicher Ausrichtung sowie drei Kompetenzen für die Infrastruktur zur Verfügung. Unsere Ressourcen teilen wir über das JGU Netzwerk Open Iris – Geräte können hier gebucht werden.

Unsere Teams für wissenschaftliche Kompetenz

Unsere Kompetenzen für Infrastruktur

Geräte buchen

Für den Zugang der Gerät ist eine kurze Einweisung vor der ersten Nutzung erforderlich. Anschließend ist ein selbstständiger Zugang möglich.

Unser Gerät bietet Ihnen folgende Techniken:

  • Langzeit-Kryolagerung biologischer Proben

Und ist mit diesen Funktionen ausgestattet:

  • Gasphasen-Lagerung über flüssigem Stickstoff bei -170°C
  • „Sorgenfreie“ Lagerung: Stickstoff-Nachfüllung und Wartung durch die Core Facilities

Unser Gerät bietet Ihnen folgende Techniken:

  • Präparative Ultrazentrifugation von Proben

Und ist mit diesen Funktionen ausgestattet:

  • Große Auswahl an Swing-Out- und Festwinkel-Rotoren
  • Zentrifugation bis 500 000g
  • Temperierung zwischen 4°C und 25°C

Unser Gerät bietet Ihnen folgende Techniken:

  • Vollständig ausgestattetes Insektenzellkultur-Labor
  • Für die Nutzung wird eine geringe Tagesgebühr erhoben

Und ist mit diesen Funktionen ausgestattet:

  • Steriles Arbeiten in einer Sicherheitswerkbank (Klasse 2)
  • Probeninkubation bei 27°C im Schüttler (Kuhner, Infors)
  • Automatischer Zellzähler (Denovix)
  • Fluoreszenz-Mikroskop (Leica)

Unser Gerät bietet Ihnen folgende Techniken:

  • Identifizierung von niedermolekularen Substanzen aus komplexen Proben

Und ist mit diesen Funktionen ausgestattet:

  • Agilent Gaschromatograph (GC 88990) und Massenspektrometer (MS 5977C) mit Autosampler
  • Quadrupol- Massenspektrometer
  • Auftrennung von komplexen Gemischen aus hydrophoben, niedermolekularen Substanzen (< 1000 Da)
  • Identifizierung von Substanzen anhand von Massenspektren

Unser Gerät bietet Ihnen folgende Techniken:

  • UV/Vis Absorptionspektroskopie für flüssigen Proben

Und ist mit diesen Funktionen ausgestattet:

  • Hochgenaue, rauscharme Absorptionsspektren
  • Messbereich im UV/Vis (190-900nm)
  • Temperierung von 4°C – 35°C Kinetikmessungen

Unser Gerät bietet Ihnen folgende Techniken:

  • UV/Vis Fluoreszenz-Spektroskopie für flüssige Proben

Und ist mit diesen Funktionen ausgestattet:

  • Hochgenaue, rauscharme Fluoreszenzspektren
  • Messbereich im UV/Vis (200-900nm)
  • Temperierung von 4°C – 35°C
  • Kinetikmessungen

Unser Gerät bietet Ihnen folgende Techniken:

  • Charakterisierung von flüssigen biologischen Proben mit dynamischer Lichtstreuung

Und ist mit diesen Funktionen ausgestattet:

  • Messung von Größenverteilungen
  • Messung von Diffusionskoeffizienten
  • Partikelgrößenbereich von 0,3nm – 10µm
  • Temperierung von 4°C – 35°C
  • Kinetikmessungen

Unser Gerät bietet Ihnen folgende Techniken:

  • Charakterisierung von flüssigen biologischen Proben mit Nanopartikel-Tracking

Und ist mit diesen Funktionen ausgestattet:

  • Messung von Größenverteilungen
  • Partikelgrößenbereich von 20nm – 1µm

Merkmale

  • Bindungsaffinität
  • Bindungskinetik
  • Markierungsfrei
  • Echtzeitmessungen

weitere Informationen

Kontakt

Merkmale

  • Proteinstabilität (Temperatur, chemische Denaturierung)
  • Proteinaggregation
  • Label-frei (intrinsische Trp-, Tyr-Fluoreszenz)

weitere Informationen

Kontakt

Gerne berate ich Sie in Ihren Anliegen und den Methoden der Biomoleküle und Bioanalytik. Ich freue mich auf die Zusammenarbeit!

TEM-Kompetenz für Forschung, Training und Beratung in den Lebenswissenschaften. Gerne beraten wir Sie in Ihren Anliegen zur Transelektronenmikroskopie und freuen uns auf die Zusammenarbeit!

Unser Gerät bietet Ihnen folgende Techniken:

  • STED, FLIM, klassische konfokale Mikroskopie.

Und ist mit diesen Funktionen ausgestattet:

  • Inverse Architecture, 20-fach Immersion, 86-fach Wasser, 93-fach Glycerin und 100-fach Öl-Objektive. 2 x HyDS und 2 x HyDX Detektoren
  • steht bereit in Raum BZ1, 03.157.

Unser Gerät bietet Ihnen folgende Techniken:

  • klassische konfokale Mikroskopie, FRAP

Und ist mit diesen Funktionen ausgestattet:

  • Aufrechte Architektur, 10-fach Luft, 20-fach Immersion, 40-fach Öl und 63-fach Glycerin sowie 20-fach, 40-fach und 63-fach Wasserobjektive, 2 x PMT und 1 x HyD Detektoren
  • steht bereit in Raum BZ1, 02.311

Unser Gerät bietet Ihnen folgende Techniken:

  • klassische konfokale Mikroskopie, FRAP, Live-Zell-Bildgebung

Und ist mit diesen Funktionen ausgestattet:

  • Inverse Architektur, 10-fach und 20-fach Luft, 40-fach Öl und 63-fach Glycerin Objektive. 2 x HyD und 2x PMT Detektoren
  • steht bereit in Raum BZ1, 02.309

Unser Gerät bietet Ihnen folgende Techniken:

  • klassische Transmissions-Fluoreszenz-Mikroskopie, Live-Zell-Bildgebung

Und ist mit diesen Funktionen ausgestattet:

  • Inverse Architektur, Präparatssucher/Stichprobensucher, Apotom3 (weitere Details folgen)dsDNA

Unser Gerät bietet Ihnen folgende Techniken:

  • Langzeit-In-Vivo-Mikroskopie mit sehr geringer Phototoxizität

Und ist mit diesen Funktionen ausgestattet:

  • Inverse Architektur, exzellente 40-fach-Wasser-Objektiv
    (weitere Details folgen)

Unser Gerät bietet Ihnen folgende Techniken:

  • Konfokal-Mikroskopie mit der Option Airyscan 2

Und ist mit diesen Funktionen ausgestattet:

  • Inverse Architektur (weitere Details folgen)

Unser Gerät bietet Ihnen folgende Techniken:

  • Konfokal-Mikroskopie mit der Option Airyscan 2, Breitbandspektrum, FLIM, FRAP, FRET möglich

Und ist mit diesen Funktionen ausgestattet:

  • Inverse Architecture (weitere Details folgen)

Unser Gerät bietet Ihnen folgende Techniken:

  • Fluoreszenz Stereo-Zoom-Mikroskopie mit Apotome 3, Farb- und Monochromkamera

Und ist mit diesen Funktionen ausgestattet:

  • Fluoreszenz-Mikroskopie für große Objekte, Optische Schnitte

Sie haben ein Anliegen oder Fragen zur Lichtmikroskopie? Gerne beraten wir Sie.

Mit unseren Geräten bieten wir Ihnen verschiedene Sequenzierungsanwendungen:

  • Whole Genome Sequencing
    (assembly, SV- and SNV detection, phasing)
  • Whole Transcriptome Sequencing
    (gene expression, splice variation, fusion transcripts, RNA-modification)
  • Epigenetics
  • Metagenomics
  • Targeted Sequencing
  • 16S Analysis
  • Hochauflösende qualitative und quantitative Analyse von HMW-gDNA bis zu ~160–165 kb mittels gepulster Kapillarelektrophorese
  • Hochempfindliche Größenbestimmung und Quantifizierung von DNA- und RNA-Proben im Pikogramm-Bereich
  • Qualitätskontrolle von Long-Read-Sequenzierungsbibliotheken und anderen DNA-Fragmenten, einschließlich Integritätsbewertung und Fragmentgrößenverteilungsprofilen
  • Bewertung der RNA-Integrität und der Gesamt-RNA-Qualität (RIN/RQN-ähnliche Metriken) zur Freigabe von Proben für die nachgelagerte Bibliotheksvorbereitung

Qualitätskontrolle von DNA und RNA

  • Größenbestimmung und Quantifizierung von gDNA- und Long-Read-Sequenzierungsbibliotheken
  • Qualitätskontrolle von NGS-Bibliotheken
  • RNA-Integrität der Gesamt-RNA

Qualitätskontrolle von mRNA/ polyA+ RNA

  • Quantifizierung und Größenbestimmung von kleiner RNA und microRNA

Fluorometrische Quantifizierung von…

  • dsDNA
  • ssDNA
  • RNA

Spektralphotometrische Quantifizierung von…

  • DNA
  • RNA

Quantifizierung in Mikrovolumen oder Küvetten
  • Kontrollierte Fragmentierung von HMW-gDNA für nachgelagerte Anwendungen (z. B. PacBio, Oxford Nanopore)
  • Erzeugung enger und hoch reproduzierbarer DNA-Größenbereiche von ~5 kb bis >100 kb, optimiert für spezifische Bibliotheksanforderungen
  • Homogenisierung hochviskoser DNA-Proben unter Beibehaltung der DNA-Integrität
  • Optionale Qualitätskontrolle der gescherten DNA auf nachgeschalteten Plattformen (z. B. Fragment Analyzer oder Femto Pulse) auf Anfrage
  • Chromatin-Shearing
  • DNA-Shearing für NGS
  • DNA-Extraktion von FFPE-Proben
  • RNA-Shearing
  • 96-well, 5-Farben plus FRET
  • 384-well, 4-Farben plus FRET
  • Allgemeine Projektberatung
  • Anreicherung von HMW-DNA (CirculomicsTM)
  • Spezielle Gelelektrophorese für HMW-DNA
  • Fragmentierung und Größenselektion von DNA
  • Unterstützung bei der Illumina-Sequenzierung

Kontaktieren Sie uns gerne für Unterstützung bei Konzeption und Umsetzung Ihres nächsten Projektes.

Wir begleiten Ihre Projekte von der Planung und Probenvorbereitung bis zur Auswertung, zugeschnitten auf Ihre spezifischen Anforderungen.

Auch für eine weiterführende Datenanalyse stehen wir Ihnen zur Seite und unterstützen Sie bei der effizienten und reproduzierbaren Auswertung Ihrer Sequenzierdaten mit folgende Kernkompetenzen:

Wir unterstützen Sie bei der Erstellung von hochwertigen Referenz-Genomen.

  • Durch moderne Algorithmen realisieren wir haplotype-resolved de novo Genomassemblierungen, auch für komplexe Genome.
  • Darauf aufbauend führen wir zuverlässige Gen-Vorhersagen und Annotationen durch.
  • Zudem bieten wir spezialisierte Bioinformatik-Workflows zur Analyse von DNA-Modifikationen (wie 5mC) direkt aus nativen Nanopore-Sequenzierdaten an, um epigenetische Fragestellungen detailliert zu beantworten.

Für ein tiefgreifendes Verständnis der Genexpression werten wir Ihre RNA-Seq Daten aus. Unsere etablierten Workflows umfassen

  • die robuste Quantifizierung der differentiellen Genexpression
  • sowie die Detektion alternativer Transkript-Isoformen.
  • Darüber hinaus ermöglichen unsere Analysepipelines die Identifikation und Kartierung von RNA-Modifikationen (Epitranskriptomik), um das volle Potenzial moderner Long-Read-Technologien auszuschöpfen.

Die bioinformatische Charakterisierung komplexer mikrobieller Gemeinschaften oder spezifischer Umweltproben erfolgt über unsere dedizierten metagenomischen Workflows. Wir bieten

  • sowohl die Auswertung von WGS-basierten Metagenom-Daten für tiefe taxonomische Einblicke
  • als auch die effiziente Analyse von amplikonbasierten Metabarcoding-Daten zur präzisen Speziesidentifikation und Diversitätsbestimmung an.

Ein modernes und sicheres Forschungsdatenmanagement ist das Fundament reproduzierbarer Wissenschaft. Als zentrale IT-Lösung betreuen wir das elektronische Laborbuch eLabFTW. Unser Service umfasst

  • die vollständige technische Administration und Wartung sowie
  • eine strukturierte Einführung und Schulung für neue Arbeitsgruppen.
  • Dies ermöglicht es, Ihre Laborprozesse digital abzubilden und
  • Versuche und Forschungsdaten rechtssicher zu dokumentieren.
  • Flüssige und feste S1-Abfälle
  • Kulturmedien & mikrobiologische Reststoffe
  • Geeignete Autoklavierprogramme
  • Prozessüberwachung & Dokumentation
  • Regelkonforme Entsorgungsvorbereitung
  • Glaswaren (Kolben, Flaschen, Bechergläser etc.)
  • Autoklavierbare Kunststoffe
  • Spezial- und Großlaborgeschirr
  • Optimierte Spülprogramme
  • Angepasste Reinigungsmittel-Dosierung
  • Materialschonende Prozesse
  • Für temperaturstabile Materialien
  • Thermische Behandlung je nach Anforderung
  • Überwachte Sterilisationszyklen
  • Für temperaturstabile Materialien
  • Thermische Behandlung je nach Anforderung
  • Überwachte Sterilisationszyklen
  • Glaswaren & Kunststoffe
  • Effiziente, rückstandsfreie Trocknung
  • Unterstützung bei Prozessanpassungen
  • Technische Betreuung
  • Qualitätssichernde Dokumentation

Vor Aufnahme unserer Servicetätigkeiten benötigen wir eine Benutzeranforderung von Ihnen. Bitte kontaktieren Sie uns!

Für einen reibungslosen Ablauf und optimale Spülergebnisse zu gewährleisten, bitten wir die nachfolgenden Annahmezeiten und Hinweise zu beachten, die Materialien korrekt zu kennzeichnen und transportsicher bereitzustellen. Bitte beachten Sie, dass nur unbeschädigte Materialien von uns aufbereitet werden können.

Eine Abgabe ist möglich:

  • 24 Stunden / 7 Tage die Woche
  • Hinweis: Nur bei verfügbarer Kapazität der Übergabeboxen. Eine Annahme ist nur möglich, solange freie Übergabeboxen vorhanden sind.

Eine Abgabe ist möglich:

  • Montag-Donnerstag: 7:00 – 13:00 Uhr          
  • Freitag: 7:00 – 12:00 Uhr    

Bitte beachten Sie

  • Spülgefäße müssen mindestens 55 Grad hitzebeständig sein, vorgereinigt und rückstandsfrei!
  • Aufkleber, Etiketten und Beschriftungen (außer Kennung) sind zu entfernen.
  • Einwegmaterial wird nicht aufbereitet!

Eine Abgabe ist möglich:

  • Montag-Donnerstag: 7:00 – 11:00 Uhr
  • Freitag: 7:00 – 10:00 Uhr
  • Anlieferung und Abholung der Utensilien (Laborgeschirr/ Autoklaviergut) erfolgen im Untergeschoß des BZ 2, Wechselzone vor der SML Raum Nr. -1.508. Die Transportwagen hierfür wurden Ihnen schon zur Verfügung gestellt. Das Laborgeschirr sollte mit einer Kennung versehen sein (Kürzel der AG).
  • Sollten Sie noch keine Kennung haben, sprechen Sie uns an. Wir übernehmen das gerne für Sie.
  • Bereitstellung der aufbereiteten Materialien auf Transportwagen in der Wechselzone vor der SML im Keller. Nach gesendeter Abholinfo per eMail ist die Verantwortung an die AG übergeben.
  • Laborkittel:
    Es besteht die Möglichkeit, im BZ1, Raum-Nr. 00.413, Kittel selbst zu waschen und zu trocknen
  • Notduschen-Prüfgerät:
    Für die Ausleihe des Notduschen-Prüfgerätes bedarf es vorheriger Reservierung über folgenden Link: https://teamweb.uni-mainz.de/fb10/BiologieResources/default.aspx
    Bitte beachten Sie zur Ausleihe und Abgabe die Öffnungszeiten des SMLCF.

Sie haben besondere Wünsche oder ein anderes Anliegen an unser Team?

Gerne beraten wir Sie in Ihren Anliegen und freuen uns auf gute Zusammenarbeit!
  • Metalle (Stahl, Edelstahl, Aluminium, Messing, Kupfer)
  • Holz
  • Kunststoffe
  • 3D-Druck für komplexe Geometrien und Rapid Prototyping
  • Lasercutting für präzise Schnitte in verschiedenen Materialien
  • CNC-Fertigung (Fräsen, Drehen) für hochgenaue Produktionen
  • Klassische Zerspanung (manuelle Fräse, Drehbank, Bohrwerk)
  • Leiterplattenkonstruktion, -Entflechtung und -Bestückung (Standard-, SMD-Bauteile, Mikrocontroller)
  • 2D- und 3D-Konstruktions-Software für detaillierte Zeichnungen und Modelle
  • Präparieren von u.a. Vögeln und Insekten
  • Reparatur und Wartung wissenschaftlicher Geräte und Apparaturen
  • Kosten- und Machbarkeitsanalyse für Reparaturen und Umbauten

Für Aufträge und Anfragen bitte immer diese Kontaktmöglichkeiten verwenden. Wir freuen uns auf die Zusammenarbeit!

Unser Team | Gerne beraten wir Sie in Ihren Anliegen…

… für Elektronik und 3D Druck

… für Feinmechanik und Lasercutter

… für Tier-/Präparate

… für Feinmechanik

… für Feinmechanik und CNC

Einblicke | Wir sind stolz auf unsere »besten Stücke«.

Nutzen Sie unsere Angebote, werden Sie aktiv und suchen Sie die Ansprechpartner/-innen auf, die Ihnen bei Ihrem Anliegen weiterhelfen können.

In den Core Facilities am Fachbereich Biologie erhalten Sie kompetente Unterstützung für Ihre fachwissenschaftlichen und technischen Fragestellungen. Es stehen vier Teams mit unterschiedlicher wissenschaftlicher Ausrichtung sowie zwei Kompetenzen für die Infrastruktur zur Verfügung.

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